МБОУ гимназия № 40 активно сотрудничает с ГБУ ДО КК ДЮСШ "Академией футбола". 

Более 20 лет школа является базовой командой юношеских сборных по футболу Краснодарского края, неоднократных победителей и призеров Всероссийских соревнований.        

Предметом особой гордости являются десятки ее выпускников, получивших путевки в ведущие клубы российского чемпионата и сборных команд страны всех рангов. Более 30 игроков переданы в клубы первого и второго дивизионов первенства России.

«Академия футбола» - единственная в истории российского футбола школа, которая была представлена в национальной сборной страны образца 2000 года тремя воспитанниками: Максимом Бузникиным, Максимом Деменко и Дмитрием Хохловым.

 По инициативе Министерства образования, науки и молодежной политики Краснодарского края для осуществления спортивной, образовательной и воспитательной деятельности с наиболее перспективными юными футболистами Кубани на базе "Академии футбола" был организован интернат. Интернат рассчитан на 45 мест для мальчиков в возрасте от 12 до 17 лет. Общее среднее образование воспитанники Интерната получают в спортивных классах МБОУ Гимназии № 40, расположенной по соседству. 

Специалистами интерната разработан режим дня с учетом графика тренировок, занятий в МБОУ Гимназия № 40 и возрастных особенностей.

Достижения  2018-2019 учебного года:

• команда 2001 года рождения - победитель первенства Краснодарского края 2018
• команда 2002 года рождения - победитель первенства России в Южном и Северо-Кавказском Федеральных округах 2018. Финалист первенства России в 2019 году, победитель первенства Краснодарского края 2019
• команда 2003 года рождения - бронзовый призер первенства Краснодарского края 2018, серебряный призер первенства Краснодарского края 2019
• команда 2004 года рождения - обладатель кубка ЮФО/СКФО и России футболу 2018, серебряный призер первенства Краснодарского края 2019
• команда 2005 года рождения - победитель первенства Краснодарского края 2018 и 2019, бронзовый призер первенства России в Южном и Северо-Кавказском Федеральных округах
• команда 2006 года рождения - победитель первенства Краснодарского края 2019
• команда 2008 года рождения - победитель первенства Краснодарского края 2019